Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RtcbQ99LF4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms