Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms