Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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TrabdQ99JY4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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TrabdQ99JY4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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TrabdQ99JY4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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TrabdQ99JY4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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TrabdQ99JY4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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TrabdQ99JY4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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TrabdQ99JY4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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TrabdQ99JY4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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TrabdQ99JY4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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TrabdQ99JY4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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TrabdQ99JY4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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TrabdQ99JY4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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TrabdQ99JY4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms