Protein–RNA interactions for Protein: Q99J21

Mcoln1, Mucolipin-1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln1Q99J21 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms