Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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