Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms