Protein–RNA interactions for Protein: Q8K342

Rassf9, Ras association domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf9Q8K342 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf9Q8K342 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms