Protein–RNA interactions for Protein: Q8K194

Snrnp27, U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein, mousemouse

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Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp27Q8K194 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Snrnp27Q8K194 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Snrnp27Q8K194 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Snrnp27Q8K194 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Snrnp27Q8K194 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Snrnp27Q8K194 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Snrnp27Q8K194 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Snrnp27Q8K194 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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