Protein–RNA interactions for Protein: Q8K158

Cnppd1, Protein CNPPD1, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnppd1Q8K158 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Cnppd1Q8K158 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Cnppd1Q8K158 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Cnppd1Q8K158 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Cnppd1Q8K158 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Cnppd1Q8K158 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Cnppd1Q8K158 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Cnppd1Q8K158 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms