Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

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Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Pkn3Q8K045 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Pkn3Q8K045 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pkn3Q8K045 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pkn3Q8K045 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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