Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHX7

Rftn2, Raftlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn2Q8CHX7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms