Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms