Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms