Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Tnfsfm13Q8BXS2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsfm13Q8BXS2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsfm13Q8BXS2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tnfsfm13Q8BXS2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tnfsfm13Q8BXS2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tnfsfm13Q8BXS2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tnfsfm13Q8BXS2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tnfsfm13Q8BXS2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tnfsfm13Q8BXS2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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