Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Zfp398Q8BV16 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Zfp398Q8BV16 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Zfp398Q8BV16 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp398Q8BV16 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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