Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV0

Spock3, Testican-3, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock3Q8BKV0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spock3Q8BKV0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms