Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc38a9Q8BGD6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms