Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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Cldn34b3Q80ZS5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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