Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms