Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Pcsk9Q80W65 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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Pcsk9Q80W65 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Pcsk9Q80W65 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Pcsk9Q80W65 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Pcsk9Q80W65 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Pcsk9Q80W65 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Pcsk9Q80W65 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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