Protein–RNA interactions for Protein: Q80VU4

Ntf4, Neurotrophin-4, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf4Q80VU4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ntf4Q80VU4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ntf4Q80VU4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ntf4Q80VU4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ntf4Q80VU4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ntf4Q80VU4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ntf4Q80VU4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ntf4Q80VU4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ntf4Q80VU4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ntf4Q80VU4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ntf4Q80VU4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ntf4Q80VU4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ntf4Q80VU4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ntf4Q80VU4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ntf4Q80VU4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ntf4Q80VU4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ntf4Q80VU4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ntf4Q80VU4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ntf4Q80VU4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ntf4Q80VU4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ntf4Q80VU4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ntf4Q80VU4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ntf4Q80VU4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ntf4Q80VU4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ntf4Q80VU4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ntf4Q80VU4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ntf4Q80VU4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ntf4Q80VU4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ntf4Q80VU4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Ntf4Q80VU4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Ntf4Q80VU4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Ntf4Q80VU4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Ntf4Q80VU4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Ntf4Q80VU4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Ntf4Q80VU4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ntf4Q80VU4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ntf4Q80VU4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ntf4Q80VU4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ntf4Q80VU4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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