Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rpp38Q80UU2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rpp38Q80UU2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rpp38Q80UU2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rpp38Q80UU2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rpp38Q80UU2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rpp38Q80UU2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rpp38Q80UU2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rpp38Q80UU2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rpp38Q80UU2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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