Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms