Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms