Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cspg5Q71M36 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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