Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms