Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Syne1Q6ZWR6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Syne1Q6ZWR6 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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