Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm3635-201ENSMUST00000212314 354 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms