Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
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Ncapd3Q6ZQK0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Ncapd3Q6ZQK0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Ncapd3Q6ZQK0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Ncapd3Q6ZQK0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Ncapd3Q6ZQK0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Ncapd3Q6ZQK0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Ncapd3Q6ZQK0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Ncapd3Q6ZQK0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Ncapd3Q6ZQK0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Ncapd3Q6ZQK0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Ncapd3Q6ZQK0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Ncapd3Q6ZQK0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Ncapd3Q6ZQK0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Ncapd3Q6ZQK0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms