Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms