Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms