Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180.7 ms