Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrlQ6PE55 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms