Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gapvd1Q6PAR5 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gapvd1Q6PAR5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gapvd1Q6PAR5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms