Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
BC061212Q6P8K3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC061212Q6P8K3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC061212Q6P8K3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC061212Q6P8K3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC061212Q6P8K3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC061212Q6P8K3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC061212Q6P8K3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC061212Q6P8K3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC061212Q6P8K3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC061212Q6P8K3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC061212Q6P8K3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
BC061212Q6P8K3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC061212Q6P8K3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC061212Q6P8K3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC061212Q6P8K3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
BC061212Q6P8K3 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC061212Q6P8K3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC061212Q6P8K3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC061212Q6P8K3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC061212Q6P8K3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC061212Q6P8K3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC061212Q6P8K3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC061212Q6P8K3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC061212Q6P8K3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC061212Q6P8K3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC061212Q6P8K3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC061212Q6P8K3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC061212Q6P8K3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC061212Q6P8K3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC061212Q6P8K3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC061212Q6P8K3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC061212Q6P8K3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC061212Q6P8K3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms