Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms