Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms