Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms