Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms