Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms