Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Arhgap20Q6IFT4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Arhgap20Q6IFT4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Arhgap20Q6IFT4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Arhgap20Q6IFT4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Arhgap20Q6IFT4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Arhgap20Q6IFT4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Arhgap20Q6IFT4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Arhgap20Q6IFT4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Arhgap20Q6IFT4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Arhgap20Q6IFT4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Arhgap20Q6IFT4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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