Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms