Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms