Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ric1Q69ZJ7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ric1Q69ZJ7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ric1Q69ZJ7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ric1Q69ZJ7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ric1Q69ZJ7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ric1Q69ZJ7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ric1Q69ZJ7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ric1Q69ZJ7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ric1Q69ZJ7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ric1Q69ZJ7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ric1Q69ZJ7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ric1Q69ZJ7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ric1Q69ZJ7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ric1Q69ZJ7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ric1Q69ZJ7 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ric1Q69ZJ7 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ric1Q69ZJ7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ric1Q69ZJ7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ric1Q69ZJ7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ric1Q69ZJ7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ric1Q69ZJ7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ric1Q69ZJ7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ric1Q69ZJ7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms