Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spty2d1Q68FG3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spty2d1Q68FG3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spty2d1Q68FG3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spty2d1Q68FG3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spty2d1Q68FG3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spty2d1Q68FG3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spty2d1Q68FG3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spty2d1Q68FG3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spty2d1Q68FG3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spty2d1Q68FG3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spty2d1Q68FG3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spty2d1Q68FG3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spty2d1Q68FG3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Spty2d1Q68FG3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spty2d1Q68FG3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spty2d1Q68FG3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Spty2d1Q68FG3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Spty2d1Q68FG3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Spty2d1Q68FG3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spty2d1Q68FG3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Spty2d1Q68FG3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spty2d1Q68FG3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spty2d1Q68FG3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spty2d1Q68FG3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spty2d1Q68FG3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spty2d1Q68FG3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spty2d1Q68FG3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spty2d1Q68FG3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spty2d1Q68FG3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Spty2d1Q68FG3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms