Protein–RNA interactions for Protein: Q640N1

Aebp1, Adipocyte enhancer-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aebp1Q640N1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Aebp1Q640N1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aebp1Q640N1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms