Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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