Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkciQ62074 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkciQ62074 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkciQ62074 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkciQ62074 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms