Protein–RNA interactions for Protein: Q61315

Apc, Adenomatous polyposis coli protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcQ61315 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApcQ61315 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApcQ61315 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ApcQ61315 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms