Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atf3Q60765 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Atf3Q60765 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atf3Q60765 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atf3Q60765 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atf3Q60765 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atf3Q60765 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atf3Q60765 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atf3Q60765 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Atf3Q60765 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atf3Q60765 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atf3Q60765 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atf3Q60765 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atf3Q60765 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atf3Q60765 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atf3Q60765 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atf3Q60765 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atf3Q60765 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Atf3Q60765 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atf3Q60765 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atf3Q60765 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atf3Q60765 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atf3Q60765 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atf3Q60765 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atf3Q60765 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atf3Q60765 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atf3Q60765 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atf3Q60765 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms